Российская академия медико-социальной реабилитации имеет несколько клинических баз в Москве, Московской области и других регионах России, на которых проводится обучение специалистов, лечебная работа и научно-исследовательская деятельность.

Одной из основных клинических баз является собственный медицинский центр (г. Москва) академии, осуществляющий образовательную деятельность по ряду направлений восстановительной медицины: рефлексотерапия, физиотерапия, массаж, мануальная терапия. На базе данного центра разработана и реализуется уникальная программа диагностики рисков возникновения сердечно-сосудистых заболеваний, а также комплекс рекомендаций по снижению данных рисков и улучшению функций сердечно-сосудистой системы.

Стратегический партнер академии — «Федеральный научно-практический центр подготовки и непрерывного профессионального развития управленческих кадров здравоохранения» (г. Москва), возглавляемый профессором Н.Б. Найговзиной на базе которого проводятся семинары и практические занятия с участием зарубежных топ-специалистов в области организации здравоохранения.

15-ая городская клиническая больница (г. Москва) используется для преподавательского процесса и лечения больных с повреждениями опорно-двигательного аппарата и заболеваниями нервной системы. Здесь функционирует инновационная модель кабинета трудотерапии (эрготерапии).

В лечебно-реабилитационном центре Минздрава РФ (г. Москва) располагается кафедра клинической реабилитологии, где проводятся курсы повышения квалификации, тематических усовершенствований и профессиональной переподготовки по медицинской реабилитации, лечебной физкультуре и спортивной медицине, физиотерапии.

На базе частных амбулаторных клиник "Медиарт" (г. Москва) проводятся краткосрочные курсы повышения квалификации по направлению «Кардиореабилитация» с демонстрацией уникальных методик функционального исследования сердца. В реализации данного направления принимают участие ведущие специалисты Научного Центра сердечно-сосудистой хирургии им. А. Н. Бакулева.

Клиника восстановительной неврологии (г. Москва) является базой кафедры неврологии и клинической нейрофизиологии для проведения курсов повышения квалификации по неврологии. В работе данной кафедры участвуют сотрудники Центрального военного авиационного госпиталя, Российского государственного медицинского университета, Российского университета дружбы народов. Данная клиника сотрудничает с ведущими неврологическими и нейрореабилитационными центрами Германии, Франции, Израиля, США, Канады.

В медико-социальном реабилитационном центре в Московской области (Сергиево-Посадский район) кафедра социально-психологической реабилитации проводит курсы повышения квалификации по социально-средовой и психологической реабилитации лиц пожилого возраста. На базе данного центра академия совместно с Российским союзом нутрициологов, диетологов и специалистов пищевой индустрии разработала и успешно применяет программу восстановления здоровья при различных заболеваниях связанных с повышенной массой тела.

В Нижегородской области (г. Нижний Новгород) на клинической базе «Магнитологический медицинский центр «Мадин» реализуется образовательный проект по направлению различных методик кинезиологии.

В Удмуртской Республике (г. Ижевск) на базе современного многопрофильного медико-диагностического центра «АСПЭК» академия развивает научно-практическое направление в области активного долголетия.

В Республике Татарстан (г. Набережные Челны) академия принимает участие в создании инновационного медицинского центра с собственным стационаром, где будут осуществляются программы поддержания и укрепления здоровья с использованием природных методов.

Российская академия медико-социальной реабилитации ежегодно расширяет контакты с лечебно-реабилитационными, учебно-методическими, научными и другими организациями нашей страны, ближнего и дальнего зарубежья.